菲律宾足球实力一向不振，在2002年世界杯外围赛，菲律宾六场小组赛一场不胜榜尾出局，其中更耻辱地以0-12败给叙利亚及0-7败给阿曼。菲律宾之后决定放弃参与2006年及2010年世界杯外围赛，以便专注于发展国内青少年足球和备战参加南亚运动会及亚细安足球锦标赛。
阔别了两届世界杯外围赛后，菲律宾于2011年参加2014年世界杯外围赛，于首圈比赛在主客以总比数5-1淘汰斯里兰卡，晋级次圈；此场赛事为菲律宾在世界杯外围赛中的首场胜仗。于次圈，菲律宾以总比数1-5败给科威特出局。
近年
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2009年菲律宾企业家帕拉米（Dan Palami）出任国家队经理人，他提出了100计画，其目的在将菲律宾队的世界排名提升至百名内[2]。并且开始招揽海外归化球，以及发展职业联赛[3][4][5]。
2013年6月4日作客旺角大球场凭香港足球代表队陈伟豪失误解围变助攻。菲律宾由前锋占士杨哈斯宾头锤顶入龙门叶鸿辉十指关，结果凭此入球以1-0击败香港队。
2018年世界杯外围赛，菲律宾与乌兹别克、巴林及北韩三支亚洲强队同组，但菲律宾却曾在主场击败巴林及北韩，取得小组第三名，虽无法晋级，但创下菲律宾历来最好的世界杯外围赛成绩。
2019年亚洲杯决赛周名额增至24队，而2018年时杜利领军的菲律宾亦取得外围赛第三轮小组首名，首次晋身亚洲杯决赛周[6]。随后为求亚洲杯有所成绩，菲律宾改聘曾执教于英格兰、墨西哥国家队的斯文·约兰·艾历臣为主帅[2][7]。可惜菲律宾在分组赛分别不敌南韩、中国及吉尔吉斯，三战全败出局。
2022年世界杯外围赛，菲律宾与叙利亚、中国、马尔代夫及关岛同组，菲律宾曾在主场迫和中国，最后取得小组第三名，无法晋级第三圈外围赛。
2023年亚足联亚洲杯外围赛第三轮，菲律宾与巴勒斯坦、蒙古及也门同组。菲律宾首两场比赛只能赛和也门及险胜蒙古，在六组次名球队中位列最后，最后一场非胜不可的比赛以0-4大败给巴勒斯坦，只得以1胜1平1败得4分，于六组次名队伍当中排名垫底，无法晋级亚洲杯决赛周。